Sekvenační soupravy pro sekvenátor Revio – rámcová dohoda 2026–2028

Předmět zakázky

Předmětem veřejné zakázky zajištění dodávek sekvenační chemie pro pracoviště Centrum excelence Creatic LF MU, podrobně specifikovaných v technických podmínkách zadavatele a provedených za obchodních podmínek specifikovaných v příloze A zadávací dokumentace. Masarykova univerzita v rámci svého přístrojového vybavení disponuje přístrojovým vybavením vhodným k provedení sekvenování třetí generace nebo také sekvenování dlouhých čtení (long-read sequencing), a to sekvenátorem Revio System od výrobce Pacific Biosciences (PacBio), 1305 O’Brien Drive, Menlo Park, CA 94025, USA. Pro řádné provedené sekvenací metodou sekvenování dlouhých čtení (long-read sequencing) na tomto přístroji je nezbytná odpovídající sekvenační chemie plně kompatibilní se stávajícím přístrojem. Pro plánované sekvenování vzorků pomocí sekvenátoru Revio systém je nezbytné použít reagencie a příslušné sady/kity, které jsou plně kompatibilní s tímto systémem a zajišťují správnou funkčnost celého pracovního postupu. Pro zajištění správné funkčnosti a spolehlivosti celého sekvenačního procesu je nutné pořídit reagencie a kity, které tvoří komplexní a kompatibilní systém pokrývající všechny kroky pracovního postupu – od izolace nukleových kyselin, přes přípravu sekvenačních knihoven, až po samotné sekvenování na daném přístroji. Jednotlivé části tohoto procesu jsou technologicky propojené a optimalizované tak, aby fungovaly jako jeden celek. Změna dodavatele nebo výrobce v některé části (izolace, příprava knihovny, sekvenační chemie) by mohla vést k nekompatibilitě mezi reagenciemi, snížení kvality dat nebo selhání sekvenačního běhu. Z tohoto důvodu je žádoucí (nikoliv nezbytné), aby reagencie a kity použité v rámci daného pracovního postupu pocházely od jednoho výrobce či dodavatele, který zaručuje jejich vzájemnou kompatibilitu, validaci a podporu pro konkrétní typ sekvenačního systému Revio. Vzhledem k zachování stávajících investic a vzhledem k vysoké pořizovací ceně tohoto přístroje není možné cíle zadavatele naplnit jiným možným způsobem než využitím tohoto stávajícího přístrojového vybavení.