Licence software Ridom Bioinformatics

Předmět zakázky

Licence k SW Seqsphere+ (Ridom, DE) umožňující bez programátorského a bioinformatického vzdělání kompletní zpracování NGS dat pro nemocniční epidemiologii a to včetně sestavení genomu z NGS dat, MLST, cgMLST, SNV (single nucleotide variant) analýzy a hodnocení accessory genů. Umožňuje prospektivní sledování nemocniční epidemiologie, řešení outbreaků, analýzu virulomu a resistomu nejvýznamnějších nozokomiálních patogenních bakterií (Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Enterococcus faecium, atd.)